1 Ocak 1993 tarihinden itibaren eski Çekoslovakya’nın Çek ve Slovak Cumhuriyetleri olarak bölünmesiyle birlikte, her iki Cumhuriyet Çekoslovakya’nın uluslararası anlaşmalardan doğan yükümlülüklerini aynen kabul ettiklerini açıklamışlardır.

1/95 Sayılı  Türkiye-AB Gümrük Birliği Kararı ile Türkiye’nin yüklendiği hükümler nedeniyle Türkiye, Çek Cumhuriyeti ile 3.10.1997 tarihinde serbest ticaret anlaşması imzalamış ve ticari ilişkiler 1.9.1998’den itibaren bu anlaşma çerçevesinde yürütülmüştür.  Ancak, 2004 yılı mayıs ayında Çek Cumhuriyetinin AB üyesi olmasıyla, ticari ilişkiler fiilen gümrük birliği çerçevesinde yürümektedir.

Çek Cumhuriyeti İstatistik Ofisi verilerine göre, Çek Cumhuriyetinin Türkiye kaynaklı ithalatı 2000 yılında 111 milyon dolar seviyesindeyken 2004 yılında 418 ve 2005 yılında ise 534 milyon dolara yükselmiştir.

Türkiye’ye yaptığı ihracat ise 2000 yılında 159 milyon dolar düzeyindeyken, 2004 yılında 537 ve 2005 yılında da 522 milyon dolar düzeyinde gerçekleşmiştir.